新疆医科大学的前身为新疆医学院和新疆中医学院。新疆医科大学主要的3个校区：雪莲山校区位于乌鲁木齐市水磨沟区尚德北路567号。新医路校区位于乌鲁木齐市新医路393号。巴州校区位于新疆巴音郭楞蒙古自治州库尔勒市英下乡北京路89号。

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