小规模纳税人将其减免税应该计入“营业外收入”会计科目核算，具体的会计分录如下：

借：银行存款/库存现金，

贷：主营业务收入，

贷：应交税费—应交增值税。

达到减免税条件时，其做如下分录：

借：应交税费—应交增值税(减免税款)，

贷：营业外收入(减免税款)。

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