团总支和学生会的区别在于性质和基本任务。

团总支是在党委和共青团团委领导下的青年团总支部委员会，主要是用于主持召开团支部书记会议，传达党总支和上级的精神和决议，同时也可向党总支和上级反映情况、汇报工作等。而学生会是学校党委指导下的学生组织，主要是用于维护校纪校规、倡导好的学风、校风，组织同学们开展各种有益的活动等。

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