非等位基因就是位于同源染色体的不同位置上或非同源染色体上的基因，如：高茎基因D与红花基因C。

若干非等位基因只有同时存在时才出现某一性状，其中任何一个发生突变时都会导致同一突变型性状，这些基因称为互补基因。影响同一性状的两个非等位基因在一起时，得以表现性状的基因称为异位显性基因或称上位基因。

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