台湾东吴大学经过过去二十年的耕耘，已成为一结构完整的综合性大学。此时期的台湾东吴大学发展为两个校区。外双溪校区位于文化风景区，安置文、外语及理三学院；城中校区位于政经文化中心，安置法、商两学院及推广部。两校区均属台北市的精华区域。东吴大学已演变成一有特色、有内涵、有制度的精致大学。历任校长致力于提升学术研究能力、拓展与国际及大陆的学术交流、推行校务运作制度化，并与社区建立良好互动关系。东吴与附近中小学形成一校群彼此支持。国内各地校友会、系友会及校友总会亦相继成立。公元二千年东吴庆祝建校一百年，展望未来台湾东吴大学仍将秉持「养天地正气法古今完人」的校训精神，以「教育而得天下之英才」的办学理念，培育「朴实热诚坚毅专业通识宏观」的青年学子。不仅要维护学校作为人才培育的胜境，更在新世纪致力发展成为学术研究的清源。

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