多菌灵主要的作用是用来消毒的，例如根系腐烂，扦插或者嫁接繁殖的时候用在伤口上，能避免伤口感染细菌。种植植物的时候在土壤里面撒一些多菌灵粉末，这样不仅能消毒，还可避免细菌侵害。很少用来喷洒或者灌根的。不过若是植物感染了病害，可用稀释后的多菌灵溶液灌根或者喷洒再植株表面，也是用来杀菌消毒的。

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